Епархиальный Музей в городе Седльце возник в 1918 г. Это год, когда римский папа Бенедикт XV возродил после разделов яновскую, т. е. подляскую епархию. Епископом стал тогда Хенрык Пжезьдзиецки, призвав к жизни музей, который существует до сих пор. Его первым организатором был ксёндз Карл Дембиньски, доктор Духовной Академии в Санкт-Петербурге и профессор этого училища (перед совецкой революцией), официал Епископского Суда в городе Янув Подляски и в городе Седльце, генеральный викарий Курии, основатель Консистории Епископского лицея в городе Седльце. Для нужды правительства, в 1919 г. наступил первый список экспонатов, из которого остался сегодня только список монет и несколько слов о некоторых экспонатах. Перенос коллекций Музея в здание консистории в город Седльце и организация экспозиции наступили в 1922 г. В 1939-1945 г. оккупанты разграбили и уничтожили Музей. К счастью, удалось укрыть часть наиболее ценных экспонатов, а сделал это ксёндз Ян Грабовски.

В 1974 г. епископ Ян Мазур из города Седльце назначает должность председателя Епархиальной Артистично-архитектонической Комиссии - охватывает его вспомогательный епископ Вацлав Скоморуха, а Епархиальным реставраторoм памятников стал Тадеуш Кулик. Задачей этих управлений было, между прочим, коллекционирование изъятых из культа объектов искусства с целью спасения культурных ценностей перед разорением, разбросанностью или отчуждением. Годы 1974-1991 это время реставрации 125-и наиболее ценных картин на досках и на холсте, деревянных скульптур, рукописей и тканей. Эти дела сделали специалисты из "ПКЗ" и частных консерваторских мастерских из Варшавы, Торyня, Кракова, Гданьска и Седлец.

От 1991 г. Музей находится на улицы Епископа Игнацего Сьвирского м. 56. Работы над адаптацией и организацией нового местонахождения длились до 2000 г. Тогда умирает ксёндз Тадеуш Кулик, который организовал их после войны. В миллениумный год Епископ Ян Виктор Новак основывает Епархиальный Музей, назначая директора - ксёндза Хенрыка Дрозда - историка искусства. Открытие здания наступило 1 июня 2000 г. Важным событием была экспозиция одной в Польше картины - „Экстаз святого Франциска”, которое наступило 15 октября 2004 г. Епископ Збигнев Киерниковски благодарит ксёндза Хенрыка Дрозда за труд открытия и функционирования Mузея, а новым директором назначает ксёндза Роберта Мироньчука, доктора истории искусства.